时间是近未来，地点是日本。
警察部队正在追捕奇怪机器人带领的暴走集团，但在敌人的火力下，警方显得不堪一击。英勇应击的女警秋夏子名悬一线，幸好被突然出现的神秘女子救下。随后又有多起案件，同样是在警方束手无策时，神秘女子出手解决事件。原来，这位神秘女子是自称Cutie Honey拥有魔法能力的正义战士，她要面对的是同样拥有魔法能力的 犯罪集团“番撒圣衣”的成员、四天王、及其首领希斯塔吉尔。为了防止日本被“番撒圣衣”破坏，Cuite Honey与《每朝早报》的记者早见青儿、女警秋夏子联合起来战斗。而Cutie Honey的真实身世，则在与“番撒圣衣”的战斗中，逐渐浮出水面。